Моряковская детская юношеская спортивная школа была открыта в 1974 году, учредителем являлся Районный отдел народного образования Томского района. Приказом Управления образования муниципального образования «Томский район» от 02.07.2004 г. № 342 учреждение переименовано в муниципальное образовательное учреждение дополнительного образования детей детско-юношеская спортивная школа № 1 с. Моряковский Затон. Далее переименовано приказом Управления образования муниципального образования «Томский район» от «04» октября 2005 г. № 397 в муниципальное образовательное учреждение дополнительного образования детей «Детско-юношеская спортивная школа №1» Томского района.
В январе 2008 года прошла реорганизация школы путём присоединения ДЮСШ № 4 Томского района к ДЮСШ-1 на основании Постановления Главы Томского района (Главы Администрации) от «03» октября 2007года № 384.
МОУ ДОД «ДЮСШ № 1» Томского района переименовано в муниципальное бюджетное образовательное учреждение дополнительного образования детей «Детско-юношеская спортивная школа №1» Томского района на основании Приказа Управления образования от 13.01.2012 г. № 5.
МБОУ ДОД «ДЮСШ № 1» Томского района переименовано в муниципальное бюджетное образовательное учреждение дополнительного образования «Детско-юношеская спортивная школа № 1» Томского района на основании Приказа Управления образования от 21.12.2015 г. № 498.
